เมื่อวันที่ 31 ธันวาคม เจ้าหน้าที่ฝ่ายสอบสวนกล่าวว่า ศาลเกาหลีใต้ได้อนุมัติหมายจับประธานาธิบดียุน ซอกยอล ซึ่งถูกถอดถอนและถูกสั่งพักงานจากการประกาศกฎอัยการศึกในวันที่ 3 ธันวาคมแล้ว หลังหน่วยสืบสวนร่วมของเกาหลีใต้ (ซีไอโอ) ได้ยื่นคำร้องขอออกหมายจับยุนหนึ่งวันก่อนหน้านี้ เนื่องจากที่ผ่านมายุนปฏิเสธที่จะให้ความร่วมมือกับเจ้าหน้าที่ซึ่งออกหมายเรียกให้เขามาให้ปากคำหลายครั้ง

ซีไอโอยืนยันว่า ศาลแขวงตะวันตกของโซลได้อนุมัติหมายจับตามที่มีการร้องขอแล้ว ซึ่งสื่อท้องถิ่นระบุว่าถือเป็นครั้งแรกที่มีการออกหมายจับประธานาธิบดีเกาหลีใต้ สำนักข่าวยอนฮัปรายงานว่า หมายจับดังกล่าวจะมีผลบังคับใช้จนถึงวันที่ 6 มกราคม และหากมีการจับกุมตัวยุนแล้ว คาดว่าเขาจะถูกนำไปควบคุมตัวที่ศูนย์กักขังโซล

ทั้งนี้ ซีไอโอไม่ได้แสดงความเห็นเกี่ยวกับเหตุผลของศาลในการออกหมายจับดังกล่าว เช่นเดียวกับศาลที่ปฏิเสธจะแสดงความเห็นเช่นกัน

ยุนกำลังเผชิญกับการสอบสวนทางอาญาจากข้อกล่าวหาว่าเขาเป็นผู้นำการก่อจราจล ซึ่งเป็นหนึ่งในข้อกล่าวหาไม่กี่ข้อที่ประธานาธิบดีเกาหลีใต้ไม่มีเอกสิทธิ์คุ้มครอง อย่างไรก็ดียังไม่ชัดเจนว่าจะมีการดำเนินการตามหมายจับยุนเมื่อใดหรืออย่างไร ขณะที่หน่วยงานดูแลความปลอดภัยของประธานาธิบดีเกาหลีใต้ระบุในแถลงการณ์ว่า จะดำเนินการตามหมายจับดังกล่าวตามกระบวนการต่อไป

ซีไอโอยังบอกด้วยว่า ศาลยังอนุมัติหมายค้นบ้านพักของยุนอีกด้วย โดยก่อนหน้านี้ตำรวจได้พยายามเข้าตรวจต้นสำนักงานประธานาธิบดีซึ่งเป็นส่วนหนึ่งของกาสอบสวน แต่คว้าน้ำเหลว เนื่องจากหน่วยงานดูแลความปลอดภัยของประธานาธิบดีปิดกั้นไม่ให้เจ้าหน้าที่เข้าไปในพื้นที่ได้

ด้านนายควอน ซองดง หัวหน้าพรรคพลังประชาชนเกาหลีใต้ ซึ่งเป็นพรรครัฐบาลในปัจจุบัน กล่าวว่า ความพยายามที่จะควบคุมตัวประธานาธิบดีที่ยังอยู่ในตำแหน่งเป็นเรื่องไม่เหมาะสม

ขณะที่นายคิม ยองมิน สมาชิกรัฐสภาเกาหลีใต้จากพรรคประชาธิไตย ซึ่งเป็นพรรคฝ่ายค้ฃานที่เป็นผู้นำในการลงมติถอดถอนนายยุน กล่าวว่า กระบวนการในการออกหมายจับและการสอบสวนอาจเป็นเรื่องยากลำบากอย่างมาก พร้อมกับเรียกร้องให้เจ้าหน้าที่ฝ่ายสอบสวนดำเนินการตามหมายจับทันที